高校登录“春晖计划”合作科研项目在线申报系统下载院校使用手册，根据说明注册账户，并负责收集本校申请材料，组织符合条件的项目申报人在申报系统中填报相关信息并上传所需材料。高校审核同意后在系统中提交申报函（高校）至所在地区省级教育主管部门，部属高校按照属地管理原则执行。

省级教育主管部门在申报系统中下载省厅使用手册，注册并登录系统进行初审。初审结束后，在申报系统中将符合要求的项目申请及省级教育主管部门正式申报函在系统中一并上传提交至我中心。申请材料的初审工作包括：国内申请者及国外合作者资格是否符合申报要求；申请事项是否填写完整；上传的合作协议电子版是否符合基本规范并有申请者签名及所在高校公章等内容。

申报系统于 2022 年 9 月 1 日 0 时起开放，系统关闭时间为 9 月 30 日 24 时，逾期不再受理。